基本的にマニュアル通りインストールすれば良い。
CrySPY0.8.0を使うには
- find_wy
- pymatgen
- COMBO
が必要。
requirement.txtに
numpy >=1.10
scipy >= 0.16
Cython >= 0.22.1
pandas
pymatgen
notebook
と書いて
$ pip install -U -r requirement.txt
とすれば一発で入る。
※pymatgenのビルドが失敗した場合はpython-develを入れれば対応できる場合もある、共用計算機の場合はanacondaなどでインストールすると上手くいくときもある。
マニュアル 通りインストールすれば良い
gfortranでコンパイルする場合、エラーが出るのでコードを修正する必要がある
git clone https://github.com/tsudalab/combo3.git
Warning:tsudalab/combo repository is the python2 version.
インストールしたら
cd combo3
python setup.py install
を実行しセットアップ。一度ディレクトリの外に出てから
(python) import combo
を実行し、エラーが出てないことを確認したら成功
CrySPY0.9.0を使うには
- pyXtal
- pymatgen
- COMBO
が必要。マニュアルの通り、pyXtalがpython3.9に対応していないのでpython3.8を使う
requirement.txtに
numpy >=1.10
scipy == 1.5.4
Cython >= 0.22.1
mpi4py >= 2.0
PyXtal >= 0.1.6
pymatgen == 2020.12.31
notebook >= 6.2.0
pandas >= 1.2.1
matplotlib >= 3.3.4
と書いて
$ pip install -U -r requirement.txt
とすれば一発で入る。 ※pymatgenのビルドが失敗した場合はpython-develを入れれば対応できる場合もある、共用計算機の場合はanacondaなどでインストールすると上手くいくときもある。
git clone https://github.com/tsudalab/combo3.git
Warning:tsudalab/combo repository is the python2 version.
インストールしたら
cd combo3
python setup.py install
を実行しセットアップ。一度ディレクトリの外に出てから
(python) import combo
を実行し、エラーが出てないことを確認したら成功