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minimum.md

File metadata and controls

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minimum setup

Installしたいものリスト

  • macports
  • C/C++/fortran compiler
  • gnuplot
  • Python enviroment

下準備

XcodeとCommand line toolsを入れる。 Terminalを立ち上げて

$ gcc -v
(中略)
Apple LLVM version 10.0.0 (clang-1000.11.45.5)

と出てきたら成功(clangと出てくれば大丈夫)。

macports

macports 環境は全て/opt/に入るので、最悪ここを消せば元に戻る(らしい)。

$ sudo port selfupdate

を使う前に叩いておく。 ※Homebrewを使っても良い

C/C++/fortranコンパイラ

最新のgccを検索

$ sudo port search gcc

gcc8を入れる

$ sudo port install gcc8

インストールしたらselect

$ sudo port select --list gcc
  mp-gcc8
  none (active)
$ sudo port select --set gcc mp-gcc8
Selecting 'mp-gcc8' for 'gcc' succeeded. 'mp-gcc8' is now active.
$ sudo port select --list gcc
  mp-gcc8 (active)
  none

一旦、terminalをRebootしてgccにgcc8が通っているのか確認

$gcc -v
(中略)
gcc version 8.4.0 (MacPorts gcc8 8.4.0_0)

と出たら成功。
※gcc10の場合、OpenMXのコンパイルに失敗することがある

$gcc -v
(中略)
Apple LLVM version 10.0.0 (clang-1000.11.45.5)

とclangのままだと失敗
※Catalinaの場合はコンパイルの際に

fatal error: 'stdio.h' file not found

とエラーが出る場合があるので.zshrcに

export SDKROOT="$(xcrun --sdk macosx --show-sdk-path)"

と入れる必要がある

gnuplot

For Catalina User

For Catalina, macports version's gnuplot has some bugs. Please install the binary version.

Others

macports経由で

$ sudo port install gnuplot

$ gnuplot
(中略)
Terminal type is now 'aqua'
gnuplot>

と出れば成功。

Python enviroment

anacondaを使う場合(Easy)

anacondaのHPからダウンロード すぐにterminalでpythonが使えるように.bashrc(catalinaなら.zshrc)が書き換えられてるはず。

conda create --name env1
conda activate env1

でbase環境以外の仮想環境を作ることができる。CrySPY用の環境は全てココに入れたほうが良い(baseに入れてもCrySPYしか使わないのであればなんとかなる)

virtualenvを使う場合

port経由でpython3とpipを入れる

$ sudo port install python37
$ sudo port install py37-pip
$ sudo port select --list python
  none
  python27-apple (active)
  python37
$ sudo port select --set python python37
Selecting 'python37' for 'python' succeeded. 'python37' is now active.
$ python --version
Python 3.7.5

※PATHが通っていない時は.bashrcや.zshrcに

export PATH=$PATH:/Users/sawahata/Library/Python/3.8/bin

と書く必要がある。
Virtualenvで仮想環境を用意する準備

$ pip install virtualenv
$ virtualenv --version
virtualenv 20.0.28

仮想環境env1を作る

virtualenv env1

env1をactivate

source env1/bin/activate

activateしてからpip installをすることによってソースコード毎に違う環境で作業出来る。 CrySPY専用の環境もこれで作る。
※pipenvやpoetryなどを使っても良い。