Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

Management page of Muntiacus reveesi #29

Open
4 tasks
Tracked by #26
SanderDevisscher opened this issue Aug 17, 2022 · 19 comments
Open
4 tasks
Tracked by #26

Management page of Muntiacus reveesi #29

SanderDevisscher opened this issue Aug 17, 2022 · 19 comments

Comments

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator

SanderDevisscher commented Aug 17, 2022

@SanderDevisscher SanderDevisscher mentioned this issue Aug 17, 2022
13 tasks
@SanderDevisscher SanderDevisscher changed the title Muntiacus reveesi @bramdhondt/@SanderDevisscher Management page of Muntiacus reveesi Aug 17, 2022
@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

@bramdhondt hier vind je de muntjakken die opgenomen werden in het e-loket/autopsiedb. Merk op dat we ze voorzien hebben van een dummy INBO label (zie dit stuk code)

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

SanderDevisscher commented Feb 2, 2023

Ook interessant om te weten is dat dit stuk code meldingen van afschot die in dit stuk niet te definiëren valt wegschrijft. bvb sika zit hier nog niet bij en zou als ze via het e-loket gemeld worden wegeschreven moeten worden. Hetgeen nog niet gebeurd is (laatste update 02/01/2023).

@bramdhondt
Copy link
Contributor

Ok, goed zo. Ik zou het in het dashboard voorlopig houden op een figuur of tabel met aantal geschoten dieren per kalenderjaar.

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

maw een grafiek met totaal aantal geschoten individuen ? Opgesplitst per gemeente/provincie? of enkel totaal ?

Het is relatief gemakkelijk om hier een kaartje op gemeente en provincie niveau aan toe te voegen (zie grofwildpagina). Ook doen ?

@timadriaens
Copy link
Contributor

Ik zou dat precies wel doen, ja, omdat dat 1. informatiewaarde heeft 2. er een beetje hetzelfde uitziet als rosse stekelstaart. En van ondergrond idem zou ik zeggen, als er maar geen WBE afbakeningen opstaan...

@bramdhondt
Copy link
Contributor

@SanderDevisscher - Als dit al voor andere soorten is uitgewerkt (bv. rosse stekelstaart, grofwild; zoals ik begrijp van @tim), kun je muntjak wat mij betreft zo veel als mogelijk op die leest schoeien. Er is geen specifiek aspect aan muntjak die voor een andere aanpak vraagt.

Merk op dat de verwerking van de e-loketgegevens ook in de muntjak-branch is/wordt uitgewerkt. Daar gaat het om meer à la carte verwerking (i.f.v. SV's, manuscripten...) : https://github.com/inbo/fis-projecten/blob/318_Muntjak/Exoten/muntjak/scripts/Muntjak_e-loket.Rmd .

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

SanderDevisscher commented May 3, 2023

Het kan volgens mij geen kwaad om vaak terugkerende parlementaire en andere vragen in de mate van het mogelijke weer te geven op het exotenportaal, zodat wanneer er zo'n een vraag komt, verwezen kan worden naar het portaal. Dit kunnen we later nog uitwerken.

Dus samengevat:

@SanderDevisscher levert opgekuiste dataset aan obv muntjakken data uit eloket. M.a.w. drop unneeded columns. @mvarewyck moeten de datasets ook gesplitst worden in eco en geo ? voorlopig gaat dit slechts over een 50-tal dieren.
Needed columns:

  • ID
  • Wildsoort
  • AfschotDatum
  • Afschotjaar
  • Gemeente
  • Provincie

@mvarewyck werkt volgende items uit obv aangeleverde:

  1. Kaartje analoog met grofwild met totaal afschot per jaar per regio (gemeente/provincie)
  2. Line graph voor geselecteerde regio(s)
  3. Stacked barplot van het totaal aantal geschoten individuen per jaar opgesplitst per provincie

@bramdhondt @timadriaens @SanderDevisscher bekijken of er vaak terugkerende vragen zijn die eventueel ook gevisualiseerd kunnen worden obv e-loket data.

@mvarewyck
Copy link
Collaborator

@mvarewyck moeten de datasets ook gesplitst worden in eco en geo ?

@SanderDevisscher Dat lijkt me niet nodig

@bramdhondt
Copy link
Contributor

@SanderDevisscher en @mvarewyck : ik geef mee dat de geografische coördinaten van geschoten muntjakken (toch zoals ik ze destijds aangeleverd kreeg) geen consistente format hadden (decimaalteken verschoven over een verschillend aantal posities). Ik werkte daarom een fix in in mijn script: lijnen 48-61. Zie maar of jullie op hetzelfde probleem botsen, en hoe die best wordt opgelost.

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

SanderDevisscher commented May 4, 2023 via email

@bramdhondt
Copy link
Contributor

@SanderDevisscher : neen, maar het heeft inderdaad te maken met de manier waarop ik de data inlaad.

Ruwe data in de csv : 1ste lijn = 7 getallen na de komma, 2de lijn = 8 getallen na de komma

afbeelding

Eenmaal ingelezen in R wordt dit: 1ste lijn = e+12, 2de lijn = e+13

afbeelding

En dan gaat het mis... Maar jullie doen dit ongetwijfeld beter. Dus no worries.

@mvarewyck
Copy link
Collaborator

@SanderDevisscher : neen, maar het heeft inderdaad te maken met de manier waarop ik de data inlaad.

Ruwe data in de csv : 1ste lijn = 7 getallen na de komma, 2de lijn = 8 getallen na de komma

afbeelding

Eenmaal ingelezen in R wordt dit: 1ste lijn = e+12, 2de lijn = e+13

afbeelding

En dan gaat het mis... Maar jullie doen dit ongetwijfeld beter. Dus no worries.

Welke functie gebruik je om de data in te laden?
Iets als read.table(file, sep = ";", dec = ",") zou moeten werken

@bramdhondt
Copy link
Contributor

@mvarewyck - Ik lees in als read_delim("./Muntjak_DMOGG.csv", delim = ";"). Inderdaad, read.table behoudt de oorspronkelijke waarden beter.

afbeelding

Dank! Zo heb ik jullie issue toch maar even gekaapt :-)

@mvarewyck
Copy link
Collaborator

@SanderDevisscher Zijn deze data al ergens beschikbaar?

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

Not yet, ik maak tijd om dit te voorzien.

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

Ik heb wel een ongekuiste versie waar de nodige kolommen reeds in voorkomen (zie onder) maar ik ga die nog kuisen.
Muntjak_DMOGG.csv

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

SanderDevisscher commented Nov 8, 2023

Here's the cleaned data:

Muntiacus_reveesi_culling.csv

This dataset contains muntjacs shot in flanders & reported at ANB e-loket. Possibly in the future we'll have management from different sources, should I add a source column ?

@SanderDevisscher
Copy link
Collaborator Author

@Yingjie-ZhangOA @mvarewyck I would like to put this page on ice until the portal has been published or we, INBO, have secured some more finances.

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Projects
None yet
Development

No branches or pull requests

4 participants