issue 21

[cmungall]

• Fixing CHEBI IDs, fixes Fix CHEBI IDs #18
• Added CHEBI mappings. Fixes Ensure CHEBI matches are complete #21

[cmungall]

This is what I added. In cases of ambiguity (e.g. salt forms, protonation state) I prioritized based on label.

subject	subject label	object	object label
ARO:0000013	amikacin	CHEBI:2637	amikacin
ARO:0000015	methicillin	CHEBI:6827	methicillin
ARO:0000018	viomycin	CHEBI:15782	viomycin
ARO:0000021	ribostamycin	CHEBI:45257	ribostamycin
ARO:0000023	enoxacin	CHEBI:157175	enoxacin
ARO:0000024	butirosin	CHEBI:65109	butirosin
ARO:0000025	fosfomycin	CHEBI:28915	fosfomycin
ARO:0000027	roxithromycin	CHEBI:48844	roxithromycin
ARO:0000028	vancomycin	CHEBI:28001	vancomycin
ARO:0000029	teicoplanin	CHEBI:29687	teicoplanin
ARO:0000030	tigecycline	CHEBI:149836	tigecycline
ARO:0000035	sisomicin	CHEBI:9169	sisomycin
ARO:0000036	ciprofloxacin	CHEBI:100241	ciprofloxacin
ARO:0000037	apramycin	CHEBI:2790	apramycin
ARO:0000039	spectinomycin	CHEBI:9215	spectinomycin
ARO:0000040	streptomycin	CHEBI:17076	streptomycin
ARO:0000043	carbenicillin	CHEBI:3393	carbenicillin
ARO:0000046	lincomycin	CHEBI:6472	lincomycin
ARO:0000047	puromycin	CHEBI:17939	puromycin
ARO:0000049	kanamycin A	CHEBI:17630	kanamycin A
ARO:0000051	tetracycline	CHEBI:27902	tetracycline
ARO:0000052	tobramycin	CHEBI:28864	tobramycin
ARO:0000055	bicyclomycin	CHEBI:60584	bicozamycin
ARO:0000056	oxacillin	CHEBI:7809	oxacillin
ARO:0000057	telithromycin	CHEBI:29688	telithromycin
ARO:0000058	cefazolin	CHEBI:474053	cefazolin
ARO:0000059	cefepime	CHEBI:478164	cefepime
ARO:0000060	ceftazidime	CHEBI:3508	ceftazidime
ARO:0000061	ceftobiprole	CHEBI:140407	ceftobiprole
ARO:0000062	ceftriaxone	CHEBI:29007	ceftriaxone
ARO:0000063	cefuroxime	CHEBI:3515	cefuroxime
ARO:0000065	clarithromycin	CHEBI:3732	clarithromycin
ARO:0000066	clindamycin	CHEBI:3745	clindamycin
ARO:0000068	daptomycin	CHEBI:600103	daptomycin
ARO:0000069	doxycycline	CHEBI:50845	doxycycline
ARO:0000070	ertapenem	CHEBI:404903	ertapenem
ARO:0000071	levofloxacin	CHEBI:63598	levofloxacin
ARO:0000072	linezolid	CHEBI:63607	linezolid
ARO:0000073	meropenem	CHEBI:43968	meropenem
ARO:0000074	moxifloxacin	CHEBI:63611	moxifloxacin
ARO:0000075	nitrofurantoin	CHEBI:71415	nitrofurantoin
ARO:0000078	piperacillin	CHEBI:8232	piperacillin
ARO:3000022	ristocetin	CHEBI:85129	ristocetin
ARO:3000111	novobiocin	CHEBI:28368	novobiocin
ARO:3000120	balhimycin	CHEBI:47250	BALHIMYCIN
ARO:3000132	clorobiocin	CHEBI:47302	clorobiocin
ARO:3000145	tylosin	CHEBI:17658	tylosin
ARO:3000150	coumermycin A1	CHEBI:3907	coumermycin A1
ARO:3000152	minocycline	CHEBI:50694	minocycline
ARO:3000158	azithromycin	CHEBI:2955	azithromycin
ARO:3000169	rifampin	CHEBI:28077	rifampicin
ARO:3000170	imipenem	CHEBI:471744	imipenem
ARO:3000176	dirithromycin	CHEBI:474014	dirithromycin
ARO:3000184	chloroeremomycin	CHEBI:29556	chloroeremomycin
ARO:3000188	trimethoprim	CHEBI:45924	trimethoprim
ARO:3000189	oritavancin	CHEBI:82699	oritavancin
ARO:3000200	gramicidin S	CHEBI:5530	gramicidin S
ARO:3000214	hygromycin B	CHEBI:16976	hygromycin B
ARO:3000222	gramicidin A	CHEBI:80115	Gramicidin A
ARO:3000223	gramicidin B	CHEBI:188873	Gramicidin B
ARO:3000227	tyrothricin	CHEBI:201397	Tyrothricin
ARO:3000269	brodimoprim	CHEBI:131726	brodimoprim
ARO:3000284	tetroxoprim	CHEBI:135420	tetroxoprim
ARO:3000324	sulfadiazine	CHEBI:9328	sulfadiazine
ARO:3000325	sulfadimidine	CHEBI:102265	sulfamethazine
ARO:3000327	sulfadoxine	CHEBI:9329	sulfadoxine
ARO:3000329	sulfamethoxazole	CHEBI:9332	sulfamethoxazole
ARO:3000330	sulfisoxazole	CHEBI:102484	sulfisoxazole
ARO:3000337	iclaprim	CHEBI:131724	iclaprim
ARO:3000382	azidamfenicol	CHEBI:135238	azidamfenicol
ARO:3000385	chloramphenicol	CHEBI:17698	chloramphenicol
ARO:3000456	thiamphenicol	CHEBI:32215	thiamphenicol
ARO:3000461	florfenicol	CHEBI:87185	florfenicol
ARO:3000466	dalbavancin	CHEBI:82721	dalbavancin
ARO:3000488	telavancin	CHEBI:71229	telavancin
ARO:3000497	ethambutol	CHEBI:4877	ethambutol
ARO:3000517	rifaximin	CHEBI:75246	rifaximin
ARO:3000528	chlortetracycline	CHEBI:27644	chlortetracycline
ARO:3000530	rifabutin	CHEBI:45367	rifabutin
ARO:3000534	rifapentine	CHEBI:45304	rifapentine
ARO:3000550	aztreonam	CHEBI:161680	aztreonam
ARO:3000552	arsphenamine	CHEBI:9016	arsphenamine
ARO:3000554	mupirocin	CHEBI:7025	mupirocin
ARO:3000583	pristinamycin IA	CHEBI:8417	pristinamycin IA
ARO:3000584	quinupristin	CHEBI:8732	Quinupristin
ARO:3000586	pulvomycin	CHEBI:29668	Pulvomycin
ARO:3000622	colistin A	CHEBI:59064	colistin A
ARO:3000624	colistin B	CHEBI:59673	colistin B
ARO:3000625	polymyxin B1	CHEBI:8309	polymyxin B1
ARO:3000626	polymyxin B2	CHEBI:59063	polymyxin B2
ARO:3000629	bacitracin A	CHEBI:35862	bacitracin A
ARO:3000631	bacitracin F	CHEBI:221216	Bacitracin F
ARO:3000632	benzylpenicillin	CHEBI:18208	benzylpenicillin
ARO:3000633	phenoxymethylpenicillin	CHEBI:27446	phenoxymethylpenicillin
ARO:3000634	propicillin	CHEBI:52429	propicillin
ARO:3000635	dicloxacillin	CHEBI:4511	dicloxacillin
ARO:3000636	flucloxacillin	CHEBI:5098	flucloxacillin
ARO:3000637	ampicillin	CHEBI:28971	ampicillin
ARO:3000638	azlocillin	CHEBI:2956	azlocillin
ARO:3000639	mezlocillin	CHEBI:6919	mezlocillin
ARO:3000640	doripenem	CHEBI:135928	doripenem
ARO:3000641	cefalexin	CHEBI:3534	cephalexin
ARO:3000642	cefadroxil	CHEBI:3479	cefadroxil
ARO:3000643	cefotiam	CHEBI:355510	cefotiam
ARO:3000644	cefaclor	CHEBI:3478	cefaclor
ARO:3000645	cefotaxime	CHEBI:204928	cefotaxime
ARO:3000646	cefixime	CHEBI:472657	cefixime
ARO:3000647	cefpodoxime	CHEBI:3504	cefpodoxime
ARO:3000648	ceftibuten	CHEBI:3510	ceftibuten
ARO:3000649	cefditoren	CHEBI:59343	cefditoren
ARO:3000650	cefdinir	CHEBI:3485	cefdinir
ARO:3000651	ceftaroline	CHEBI:70729	ceftaroline
ARO:3000652	isepamicin	CHEBI:37951	isepamicin
ARO:3000653	G418	CHEBI:42768	geneticin
ARO:3000654	arbekacin	CHEBI:37922	arbekacin
ARO:3000655	gentamicin B	CHEBI:198034	Gentamicin B
ARO:3000657	paromomycin	CHEBI:7934	paromomycin
ARO:3000659	gatifloxacin	CHEBI:5280	gatifloxacin
ARO:3000660	lomefloxacin	CHEBI:116278	lomefloxacin
ARO:3000661	nalidixic acid	CHEBI:100147	nalidixic acid
ARO:3000662	norfloxacin	CHEBI:100246	norfloxacin
ARO:3000663	ofloxacin	CHEBI:7731	ofloxacin
ARO:3000664	trovafloxacin	CHEBI:9763	trovafloxacin
ARO:3000665	grepafloxacin	CHEBI:5543	Grepafloxacin
ARO:3000666	sparfloxacin	CHEBI:9212	sparfloxacin
ARO:3000667	demeclocycline	CHEBI:4392	demeclocycline
ARO:3000668	oxytetracycline	CHEBI:27701	oxytetracycline
ARO:3000669	virginiamycin M1	CHEBI:9997	pristinamycin IIA
ARO:3000671	tiamulin	CHEBI:44137	tiamulin
ARO:3000672	madumycin II	CHEBI:200095	A2315A
ARO:3000673	griseoviridin	CHEBI:199588	Griseoviridin
ARO:3000674	dalfopristin	CHEBI:4309	dalfopristin
ARO:3000675	pristinamycin IB	CHEBI:8418	Pristinamycin IB
ARO:3000678	pristinamycin IC	CHEBI:8419	pristinamycin IC
ARO:3000683	sulfacetamide	CHEBI:63845	sulfacetamide
ARO:3000684	mafenide	CHEBI:6633	Mafenide
ARO:3000686	thiostrepton	CHEBI:29693	thiostrepton
ARO:3000688	furazolidone	CHEBI:5195	furazolidone
ARO:3000689	metronidazole	CHEBI:6909	metronidazole
ARO:3000691	bleomycin A2	CHEBI:3139	bleomycin A2
ARO:3000692	bleomycin B2	CHEBI:28641	bleomycin B2
ARO:3000693	defensin	CHEBI:82761	defensin
ARO:3000696	Dactinomycin	CHEBI:27666	actinomycin D
ARO:3000698	sulfasalazine	CHEBI:9334	sulfasalazine
ARO:3000699	sulfamethizole	CHEBI:9331	sulfamethizole
ARO:3000700	lividomycin A	CHEBI:71961	lividomycin A
ARO:3000701	lividomycin B	CHEBI:71962	lividomycin B
ARO:3000704	cefalotin	CHEBI:124991	cefalotin
ARO:3000758	fosmidomycin	CHEBI:443725	fosmidomycin
ARO:3000759	fusidic acid	CHEBI:29013	fusidic acid
ARO:3000761	mecillinam	CHEBI:51208	mecillinam
ARO:3000762	pefloxacin	CHEBI:50199	pefloxacin
ARO:3000867	oleandomycin	CHEBI:16869	oleandomycin
ARO:3000870	triclosan	CHEBI:164200	triclosan
ARO:3001220	factumycin	CHEBI:216503	FACTUMYCIN
ARO:3001221	josamycin	CHEBI:31739	josamycin
ARO:3001222	chalcomycin	CHEBI:80016	Chalcomycin
ARO:3001223	midecamycin	CHEBI:31845	Midecamycin
ARO:3001224	mycinamicin	CHEBI:63276	mycinamicin
ARO:3001226	narbomycin	CHEBI:29649	narbomycin
ARO:3001229	rosaramicin	CHEBI:87084	rosaramicin
ARO:3001230	niddamycin	CHEBI:31908	Niddamycin
ARO:3001231	celesticetin	CHEBI:156421	celesticetin
ARO:3001232	methymycin	CHEBI:29630	methymycin
ARO:3001233	pikromycin	CHEBI:29665	pikromycin
ARO:3001234	kirromycin	CHEBI:190786	Mocimycin
ARO:3001235	aurodox	CHEBI:201478	Aurodox
ARO:3001237	GE2270A	CHEBI:29584	GE2270A
ARO:3001246	kirrothricin	CHEBI:223261	Kirrothricin
ARO:3001249	phenelfamycin A	CHEBI:222054	Phenelfamycin A
ARO:3001250	phenelfamycin B	CHEBI:222047	Phenelfamycin B
ARO:3001251	phenelfamycin C	CHEBI:222040	Phenelfamycin C
ARO:3001253	phenelfamycin E	CHEBI:222034	Phenelfamycin E
ARO:3001256	phenelfamycin F	CHEBI:222028	Phenelfamycin F
ARO:3001257	unphenelfamycin	CHEBI:222022	Unphenelfamycin
ARO:3001260	amythiamicin A	CHEBI:220214	Amythiamicin A
ARO:3001296	kasugamycin	CHEBI:81419	kasugamycin
ARO:3001314	retapamulin	CHEBI:166679	Retapamulin
ARO:3001315	valnemulin	CHEBI:29705	Valnemulin
ARO:3001316	azamulin	CHEBI:201468	Azamulin
ARO:3001317	pleuromutilin	CHEBI:8269	Pleuromutilin
ARO:3001319	fidaxomicin	CHEBI:68590	fidaxomicin
ARO:3001322	phenelfamycin G	CHEBI:203584	Phenelfamycin G
ARO:3001323	phenelfamycin H	CHEBI:225298	Phenelfamycin H
ARO:3003241	teixobactin	CHEBI:84192	teixobactin
ARO:3003412	dapsone	CHEBI:4325	dapsone
ARO:3003474	ethionamide	CHEBI:4885	ethionamide
ARO:3003571	magainin 1	CHEBI:80186	Magainin 1
ARO:3003572	magainin 2	CHEBI:80190	Magainin 2
ARO:3003690	sitafloxacin	CHEBI:4304	Sitafloxacin
ARO:3003701	rokitamycin	CHEBI:32103	Rokitamycin
ARO:3003707	faropenem	CHEBI:51788	faropenem
ARO:3003708	panipenem	CHEBI:7911	Panipenem
ARO:3003780	nybomycin	CHEBI:203472	Nybomycin
ARO:3003823	benzalkonium chloride	CHEBI:3020	benzalkonium chloride
ARO:3003831	temocillin	CHEBI:51817	temocillin
ARO:3003832	ticarcillin	CHEBI:9587	ticarcillin
ARO:3003897	tedizolid	CHEBI:82717	tedizolid
ARO:3003898	lugdunin	CHEBI:133127	lugdunin
ARO:3003915	Lysocin E	CHEBI:220095	Lysocin E
ARO:3003927	ceftolozane	CHEBI:134719	ceftolozane
ARO:3003936	Omadacycline	CHEBI:177758	Omadacycline
ARO:3003951	microcin J25	CHEBI:203056	Microcin J25
ARO:3003957	palmitic acid	CHEBI:15756	hexadecanoic acid
ARO:3003958	oleic acid	CHEBI:16196	oleic acid
ARO:3004716	Vanillobiocin	CHEBI:197618	Vanillobiocin
ARO:3004717	Isovanillobiocin	CHEBI:211429	Isovanillobiocin
ARO:3004718	Declovanillobiocin	CHEBI:206681	Declovanillobiocin
ARO:3007093	klebsidin	CHEBI:219023	Klebsidin
ARO:3007114	ornidazole	CHEBI:75176	ornidazole
ARO:3007139	cordycepin	CHEBI:29014	cordycepin
ARO:3007143	sulopenem	CHEBI:201412	Sulopenem
ARO:3007165	gemifloxacin	CHEBI:101853	gemifloxacin
ARO:3007169	pirlimycin	CHEBI:201427	Pirlimycin
ARO:3007376	gentamicin X	CHEBI:81280	Gentamicin X2
ARO:3007455	cethromycin	CHEBI:29506	cethromycin
ARO:3007468	sulfanilamide	CHEBI:45373	sulfanilamide
ARO:3007469	sulfamerazine	CHEBI:102130	sulfamerazine
ARO:3007471	narasin	CHEBI:183815	Narasin
ARO:3007472	tilmicosin	CHEBI:195409	tilmicosin
ARO:3007475	cefcapene	CHEBI:131729	cefcapene
ARO:3007481	pseudouridimycin	CHEBI:199549	Pseudouridimycin
ARO:3007485	nigericin	CHEBI:7569	nigericin
ARO:3007501	caspofungin	CHEBI:474180	caspofungin
ARO:3007502	micafungin	CHEBI:600520	micafungin
ARO:3007503	anidulafungin	CHEBI:55346	anidulafungin
ARO:3007504	amphotericin B	CHEBI:2682	amphotericin B
ARO:3007505	nystatin	CHEBI:7660	nystatin
ARO:3007506	naftifine	CHEBI:7451	naftifine
ARO:3007507	terbinafine	CHEBI:9448	terbinafine
ARO:3007508	fluconazole	CHEBI:46081	fluconazole
ARO:3007511	itraconazole	CHEBI:6076	itraconazole
ARO:3007512	voriconazole	CHEBI:10023	voriconazole
ARO:3007513	posaconazole	CHEBI:64355	posaconazole
ARO:3007514	isavuconazole	CHEBI:85979	isavuconazole
ARO:3007516	clotrimazole	CHEBI:3764	clotrimazole
ARO:3007517	ketoconazole	CHEBI:47519	ketoconazole
ARO:3007518	miconazole	CHEBI:6923	miconazole
ARO:3007519	econazole	CHEBI:4754	econazole
ARO:3007520	oxiconazole	CHEBI:7825	oxiconazole
ARO:3007521	flumequine	CHEBI:85267	flumequine
ARO:3007529	pivmecillinam	CHEBI:51210	pivmecillinam
ARO:3007534	arsinothricin	CHEBI:220158	Arsinothricin
ARO:3007541	cyclomarin A	CHEBI:182606	Cyclomarin A
ARO:3007542	cyclomarin B	CHEBI:218852	Cyclomarin B
ARO:3007543	cyclomarin C	CHEBI:211272	Cyclomarin C
ARO:3007547	salinomycin	CHEBI:80025	Salinomycin
ARO:3007570	Mycaminosyltylonolide	CHEBI:77011	5-O-mycaminosyltylonolide
ARO:3007582	formicamycin A	CHEBI:219437	Formicamycin A
ARO:3007583	formicamycin B	CHEBI:219443	Formicamycin B
ARO:3007584	formicamycin C	CHEBI:219450	Formicamycin C
ARO:3007585	formicamycin E	CHEBI:219460	Formicamycin E
ARO:3007586	formicamycin M	CHEBI:219506	Formicamycin M
ARO:3007587	formicamycin O	CHEBI:226636	Formicamycin O
ARO:3007588	formicamycin L	CHEBI:219500	Formicamycin L
ARO:3007589	formicamycin F	CHEBI:219466	Formicamycin F
ARO:3007590	formicamycin P	CHEBI:226642	Formicamycin P
ARO:3007591	formicamycin G	CHEBI:219470	Formicamycin G
ARO:3007592	formicamycin D	CHEBI:219455	Formicamycin D
ARO:3007593	formicamycin N	CHEBI:226631	Formicamycin N
ARO:3007594	formicamycin H	CHEBI:219476	Formicamycin H
ARO:3007595	formicamycin Q	CHEBI:226647	Formicamycin Q
ARO:3007596	formicamycin I	CHEBI:219484	Formicamycin I
ARO:3007597	formicamycin J	CHEBI:219490	Formicamycin J
ARO:3007598	formicamycin K	CHEBI:219496	Formicamycin K
ARO:3007601	cervimycin A	CHEBI:209712	Cervimycin A
ARO:3007602	cervimycin B	CHEBI:206185	Cervimycin B
ARO:3007603	cervimycin C	CHEBI:208953	Cervimycin C
ARO:3007604	cervimycin D	CHEBI:198705	Cervimycin D
ARO:3007616	pyrrolomycin A	CHEBI:156550	pyrrolomycin A
ARO:3007617	pyrrolomycin B	CHEBI:220052	Pyrrolomycin B
ARO:3007618	pyrrolomycin C	CHEBI:210117	Pyrrolomycin C
ARO:3007620	pyrrolomycin E	CHEBI:220086	Pyrrolomycin E
ARO:3007624	pyrrolomycin G	CHEBI:210960	Pyrrolomycin G
ARO:3007625	pyrrolomycin H	CHEBI:222702	Pyrrolomycin H
ARO:3007627	pyrrolomycin I	CHEBI:217964	Pyrrolomycin I
ARO:3007766	Marinomycin C	CHEBI:220588	Marinomycin C